По существу вопроса.
1) Перечисленные работы, если они выполнены правильно никаким образом не могут привести к названным последствиям.
2) Все ли работы, проведённые на моторе вы перечислили? Может меняли топливный фильтр?
3) Стук..... Если масло слили сегодня, потом стали снимать турбину, потом меняли картридж .... и так машина простояла несколько дней .... а если у нее маслонасос не АХ, то запросто после простоя двигатель мог не засосать масло. Крутили стартером до посинения. Если я не ошибаюсь, то не этом моторе ни лампочки масла, ни стрелки нет. Так что стук мог появиться.